比亚迪s6总是烧主继电器保险丝，这可能是因为主继电器失灵导致电流过大，使保险丝烧坏。此时，建议检查主继电器是否损坏或老化，或者是电路线路出现短路现象，导致电流过大。
另外，还应该检查车辆的电气系统是否正常，如电池、发电机、线束等。
同时也要留意车辆是否经常在恶劣环境使用，如高温、多尘、潮湿等环境下，这些情况也可能导致保险丝短路。因此，对于此类问题，需要仔细检查和维护车辆电气系统和主继电器，确保车辆正常使用，并及时更换损坏的保险丝。
如果需要更换比亚迪S6发动机电脑(ECU)，一般需要按照以下步骤进行匹配设置：
1. 更换发动机电脑(ECU)后，需要将新的ECU中的车辆配置信息进行编程，确保与车辆匹配。需要使用专业的编程设备进行设置。
2. 将车辆接入诊断仪，读取原始的车辆配置信息并备份。
3. 在专业的编程设备上打开更换电脑的菜单，将备份的原始配置信息写入到新ECU中。
4. 确认新ECU的设置和原始ECU的配置一致，并确保匹配成功。
需要注意的是，更换发动机电脑(ECU)可能会对车辆的保修和保险产生影响，因此建议找到专业的技师进行更换操作。同时，由于不同的S6车型可能具有不同的电脑(ECU)类型和匹配方式，还请您根据实际情况进行操作。